In uno studio, nell'ambito di intensi programmi di trattamento TMS o rTMS, non sono stati osservati effetti collaterali significativi. Un paziente ha ricevuto 70 sessioni di trattamento in 12 mesi, o 420.000 pulsazioni, senza effetti collaterali. Un paziente di 75 anni ha ricevuto 130 sessioni in 26 mesi con un numero totale di 156.000 stimoli, mentre 7 pazienti hanno ricevuto 60 sessioni in 12 mesi con un numero totale di 72.000 stimoli. ( Rossia ) In un altro studio a uomini sani sono stati somministrati 12.960 impulsi magnetici rTMS ad alta intensità al giorno per un massimo di 3 giorni in 1 settimana. Ciò equivale a 38.880 impulsi magnetici in 1 settimana, una delle più grandi esposizioni di rTMS fino ad oggi. Nonostante questo intenso regime di trattamento, non sono stati osservati effetti collaterali significativi. ( Anderson )
Anche nel contesto della sclerosi multipla recidivante-remittente combinata con trauma cranico, nessun paziente ha mostrato evidenza di ricaduta durante un follow-up di almeno 8 mesi. Gli autori hanno concluso che la stimolazione cerebrale magnetica era facile da eseguire, indolore e sicura. ( Ingram )